2017年6月，科睿唯安（原湯森路透知識產權與科技事業部）公布了2016版《期刊引證報告》，昆明植物研究所主辦的《真菌多樣性》（英文）最新影響因子為13.465，與2015年度的6.991相比，實現了歷史新高。
據了解，2011 年 3 月，中科院昆明植物研究所與泰國菌類研究基金會主任、《真菌多樣性》（英文）期刊創刊人K. D. Hyde 教授簽署合作協議，從此《真菌多樣性》成為該所正式官方期刊。7年來，穩步推進，使得該期刊影響因子逐年上升，在全球真菌學領域期刊中排名第二，在中國相關學術機構主辦的全部188種SCI期刊中排名第三。
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